Jurusan Kedokteran Muhammadiyah memiliki misi yang jelas, yaitu berkontribusi sebagai pusat kedokteran terkemuka di Negara ini. Untuk mencapai sasaran tersebut, berbagai inisiatif gigih dilakukan, termasuk pengembangan mutu pendidikan, penelitian mutakhir, dan dedikasi untuk keluarga luas. Di sa